在巴黎大學哲學最興盛的時代，是由兩個修會的會士在支撐整個士林哲學全盛期的發展，其中道明會的哲學，尤其是聖多瑪斯的哲學，是為主流，這多少忽略了另一個方濟會，其實兩者當時擔負的角色很平等。
方濟會哲學中的思想家，成就不如湯瑪斯偉大，但是在十三世紀也算是一流的思想家，方濟會保留了柏拉圖和奧斯定的影響，比較接近神秘主義。代表人物有三：哈勒斯、魯佩拉、波那明杜拉。
哈勒斯的代表作亦是神學大全，討論了當時神學方面所有的問題，他的哲學是以聖奧斯定做主幹，從心靈的體驗出發，慢慢地推上理智的了解，他的形上學以柏拉圖的形上論、觀念論做基礎，一方面採取柏拉圖的辯證，另一方面又不肯放棄整個聖奧斯定學說的成果。
魯佩拉特別研究人類心靈的問題，著有論靈魂大全，內容大多採用猶太和亞拉伯哲學，加上對聖奧斯定哲學的註解。他的知識論追隨亞里斯多德的經驗，經驗抽象出來的成果，形成形上學。他真正處理的問題是：如何得到知識？他採取的仍是聖奧斯定的方法，是光照，是啟示。
波那明杜拉是魯佩拉的弟子，為方濟會中最偉大的思想家，與聖多瑪斯是同班同學，一起成名。他走聖奧斯定的路線，比較屬於神秘主義，他的思想與其他方濟會思想家的幾乎相同，都接受聖奧斯定內心哲學的方案，即接受上帝的光照、啟示，這是知識的大宗來源。