利瑪竇不想再招惹麻煩，於是在隨後出的一本書中，他對於佛教採取較和緩的語氣。
有關佛教教義都記載於四十二章經內，這是第一世紀由東漢迦葉摩騰、竺法蘭兩位印度僧人所翻譯，也是古代中國譯出的第一部佛教經典。利瑪竇也把他在南京所寫的一本書印出並取名《二十五言》，書中不用任何辯駁的話，反而採用境遇刻苦的理論以闡揚耶穌的教義。